Gene marker的介绍、软件下载及使用教程_郑维维_新浪博客

来自 : 新浪博客 发布时间：2021-03-24

GeneMarker能够处理ABI、Amersham、Beckman、SpectruMedix等公司的毛细管电泳仪输出的DNA 片断峰图数据。它的应用领域有:* 动、植物DNA短串连重复序列STR 数据分析* 遗传学及古生物学相关研究* 遗传家系绘图与孟德尔检验（支持Linkage、GeneHunter）* 肿瘤学领域染色体杂合性缺失（LOH）分析，分析肿瘤患者染色体异常* 法医和亲缘鉴定研究，支持混合样本分析* DNA扩增片断长度多态性AFLP数据分析* 对多重连接探针扩增所得到的数据的分析* 高通量SNP分型及其聚类分析* 用于高通量染色体和DNA异常诊断的MLPA 数据分析* 微卫星不稳定性（MSI）数据分析* DNA定量比对分析GeneMarker 主要特点:一、计算分析精确采用专业优化的信号处理算法，帮助排除检测系统带来的噪音和干扰，使实验结果的真实原貌得到更准确的还原。如基线校正（BaselineSubtraction），相关性消除（Pull-up Removal），饱和信号修补（Saturation Repair）等。采用多种统计方法辅助分析，如StutterRecognition、False Plus-A Correction等，自动鉴别信号，以得到最合理精确的分型结果。二、快速分析数据及生成报告快速准确计算出等位基因（Allele）的位置，获得等位基因的RepeatNumber。优化的算法保证了数据处理运算的快捷，在我们的测试中，处理1000个样本只需276秒。良好的设计保障了软件的稳定运行，即使发生了意外，内置的异常处理模块也能防止程序的崩溃，使用户能及时保存数据。三、友好的人机交互界面友好的人机交互界面设计，支持多家厂商的数据格式。界面简单、友好，十分容易掌握，还提供向导界面，引导用户轻松完成数据处理和报告输出。支持自定义内标，支持自定义panel。自动判断每个DNA片段的内标种类。丰富的报告打印类型,输出Allele报告；输出CODIS报告。四、多个特殊定制功能集成多个功能强大的工具和应用，如MLPA分析多重连接探针扩增数据分析、定量分析功能、单倍体（Haplotype）分析功能、MS-MLPA 甲基特异性分析、家族图谱关联的微卫星分析等多达15种定制服务功能，并已得到全球2000多家实验室和研究机构良好的使用。
2014年5月12日GeneMarker是国际生物信息学相关研究分析领域应用十分广泛的DNA片断分析软件,旨在为领域科研人员、司法刑侦人员提供一个精确、快速、友好、自动化的数...Gene marker的介绍、软件下载及使用教程_郑维维_新浪博客,郑维维,Gene marker的介绍、软件下载及使用教程_郑维维_新浪博客,郑维维,Gene marker的介绍、软件下载及使用教程